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流感检测
基于华大智造自主研发的试剂、自动化样本制备系统、高通量测序平台,搭载自主开发 FluTrack 软件的流感组合产品能够快速进行甲/乙流感病毒全基因组测序、比对、分型、溯源等。这是一款面向流感病毒测序与分析的理想产品,能够为流感监测和流行病学调查提供有力支撑。
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呼吸道微生物基因组测序组合产品以华大智造自主研发的试剂、自动化样本制备系统、高通量测序平台以及数据处理系统为基础,涵盖从RNA到结果输出的全流程,部分实验流程与全部数据处理流程可实现自动化运行。本组合产品可对甲/乙流感阳性的RNA样本扩增病毒全基因组的8个片段,包括甲型HA(1-16)、NA(1-9)亚型流感和乙型Victoria与Yamagata流感,进行快速、准确、全面的高通量测序,从而为流感样本的全基因组扩增、分型、组装、溯源等应用等提供重要参考。
文库构建
测序
数据分析
文库构建是大规模平行测序的基础,本质就是在将待测定样本的基因组片段化,之后在小片段分子两端添加测序接头,形成能上机测序的有效的文库分子。
仪器设备
MGISP-100被广泛应用于高通量测序文库制备环节,并支持各种实验室自动化移液操作,搭载了8通道移液器,采用自动化流程设计以及标准化生产模式,有效防止污染,样本制备的重复性好、稳定性高、成功率高。同时MGISP-100作为一款开放平台,可以搭配多种试剂、耗材,批量处理液体样本,有效缩短实验周期,大规模解放实验室人力。
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建库试剂
本试剂盒套装基于多重RT-PCR和打断建库技术,可对甲型和乙型流感病毒全基因组的8个片段进行高效地扩增和文库制备,文库制备成DNB之后可在MGI的测序平台上进行测序,为流感病毒的分型和溯源提供了有力工具。
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MGIEasy 双Barcode环化试剂盒是针对华大智造 (MGI)高通量测序平台量身打造的模块化试剂盒。使用本试剂盒可以将连接后的MGI-双 Barcode 标准PCR产物制备成适用于MGI高通量测序仪专用的单链环状DNA文库。
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华大智造基因测序仪采用先进的DNBSEQ测序核心技术,通过仪器气液系统先将DNA纳米球(DNA nanoball DNB)泵入到规则阵列芯片(Patterned Array)并加以固定,然后泵入测序模板及测序试剂。测序模板与芯片上的DNB的接头互补杂交,在DNA聚合酶的催化下,测序京模板与测序试剂中的带荧光标记的探针相结合。然后由激光器激发荧光基团发光, 不同荧光基团所发射的光信号被相机采集,经过处理后转换成数字信号,传输到计算机进行处理,可以获取待测样本的碱基序列信息。
仪器设备
MGISEQ-200是一款小巧、灵活的桌面型单载片基因测序平台,支持高低两种通量的载片。小载片(FCS)运行速度快,大载片 (FCL) 通量高,用户可灵活选择,满足不同应用场景下对时间和通量的需求。 MGISEQ-200的两种载片搭载3-4种读长,支持开展不同测序应用,包括:低深度全基因组测序,靶向捕获/多重测序、小型基因组测序、RNA测序、全外 显子测序等科研应用或临床应用,丰富你的日运行能力。
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建库试剂
本产品是用于测定DNA或RNA文库序列的通用试剂盒,与基因测序仪(MGISEQ-200RS)配合使用,完成高通量测序并获取样本序列信息。本试剂套装仅供科研使用,不能用于临床诊断。
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用于PE双Barcode测序
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包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析、功能预测,并自动计算变异检测,结果为科学研究提供参考。
软件
MGI FluTrack软件是华大智造自研的一款用于流感的识别、组装以及溯源分析的生物信息软件。通过自主开发的数据预处理工具结合SOAPnuke软件完成数据的预处理和质控,利用BWA以及自主开发的流感阴阳性判断算法完成数据比对和病毒识别,通过自研软件工具IAP完成甲乙流的组装,并使用组装生成的甲乙流序列进行溯源分析。
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服务器
华大智造微生物快速识别与组装溯源平台是专为简化病原高通量测序基因数据分析而开发的一站式平台。该平台包含微生物快速识别软件(Microorgan isms Fast Identification Software, 简称PFI)、微生物组装溯源软件(简称MGAP)和MGI metarget COVID 软件共三款生信软件,并配备专业的实验室信息管理系统 ZLIMS,提供图形化操作界面,开机即用。
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