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病媒检测
新发虫媒传染病是新发传染病的重要组成部分,在全球呈现加剧化形势。华大智造提供病媒物种及微生物识别组合产品,无须经验预判,可实现快速、精准地鉴定输入性病媒生物的物种及近缘种。
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基于华大智造自主研发的试剂、自动化样本制备系统、高通量测序平台以及分析软件,覆盖从样本到报告全流程,对病媒生物样本进行文库制备、测序和分析,快速准确地识别病媒物种和所携带的病原微生物,为出入境检验检疫和虫媒传染病的防控提供工具支撑。
文库构建
测序
数据分析
文库构建是大规模平行测序的基础,本质就是在将待测定样本的基因组片段化,之后在小片段分子两端添加测序接头,形成能上机测序的有效的文库分子。
仪器设备
MGISP-100被广泛应用于高通量测序文库制备环节,并支持各种实验室自动化移液操作,搭载了8通道移液器,采用自动化流程设计以及标准化生产模式,有效防止污染,样本制备的重复性好、稳定性高、成功率高。同时MGISP-100作为一款开放平台,可以搭配多种试剂、耗材,批量处理液体样本,有效缩短实验周期,大规模解放实验室人力。
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建库试剂
MGIEasy 酶切DNA文库制备试剂套装是针对华大智造(MGI)高通量测序平台量身打造的WGS文库制备试剂盒。本试剂盒可以将5-400ng基因组DNA制备成高通量测序平台专用的文库。本试剂盒采用高质量的酶学组成,改进型接头连接技术以及具有强扩增效率的高保真酶,显著提高文库转化率与扩增效率,适用于包括人、动物、植物、细菌、真菌、meta等多物种的全基因组建库试剂套装。
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MGIEasy 微生物快速RNA文库制备套装是为华大智造(MGI)高通量测序平台量身打造的RNA文库构建试剂盒套装。本套装包含的DNBSEQ一步法DNB制备试剂盒可以将10ng -1μgtotal RNA制备成适用于MGI高通量测序平台的DNA纳米球(DNB)。本套装适合待检样本中微生物RNA的检测。套装中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库
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华大智造基因测序仪采用先进的DNBSEQ测序核心技术,通过仪器气液系统先将DNA纳米球(DNA nanoball DNB)泵入到规则阵列芯片(Patterned Array)并加以固定,然后泵入测序模板及测序试剂。测序模板与芯片上的DNB的接头互补杂交,在DNA聚合酶的催化下,测序京模板与测序试剂中的带荧光标记的探针相结合。然后由激光器激发荧光基团发光, 不同荧光基团所发射的光信号被相机采集,经过处理后转换成数字信号,传输到计算机进行处理,可以获取待测样本的碱基序列信息。
仪器设备
MGISEQ-200是一款小巧、灵活的桌面型单载片基因测序平台,支持高低两种通量的载片。小载片(FCS)运行速度快,大载片 (FCL) 通量高,用户可灵活选择,满足不同应用场景下对时间和通量的需求。 MGISEQ-200的两种载片搭载3-4种读长,支持开展不同测序应用,包括:低深度全基因组测序,靶向捕获/多重测序、小型基因组测序、RNA测序、全外 显子测序等科研应用或临床应用,丰富你的日运行能力。
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测序试剂
本产品是用于测定DNA或RNA文库序列的通用试剂盒,与基因测序仪(MGISEQ-200RS)配合使用,完成高通量测序并获取样本序列信息。本试剂套装仅供科研使用,不能用于临床诊断。
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用于SE双Barcode测序
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该试剂盒是用文库进行滚环复制获得DNA纳米球,适用于高通量测序平台测序前的样本处理。
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包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析、功能预测,并自动计算变异检测,结果为科学研究提供参考。
软件
病媒物种及微生物识别软件是专为简化病媒物种鉴定及病原微生物识别而开发的软件,具有检测通量高,一次测序可以同时识别病媒物种与携带病原,流程标准化等优势。
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服务器
华大智造微生物快速识别与组装溯源平台是专为简化病原高通量测序基因数据分析而开发的一站式平台。该平台包含微生物快速识别软件(Microorgan isms Fast Identification Software, 简称PFI)、微生物组装溯源软件(简称MGAP)和MGI metarget COVID 软件共三款生信软件,并配备专业的实验室信息管理系统 ZLIMS,提供图形化操作界面,开机即用。
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