本软件通过对单菌株(临床样本实验室分离出的单个菌株)DNA测序数据进行分析,可对单个菌株的测序数据进行基因组组装及菌株鉴定,并可对多个菌株进行溯源分析,可根据此结果获得特定病原菌的流行病学信息。软件为B/S架构,使用者可直接通过浏览器进行任务提交的方式进行菌株组装鉴定和菌株溯源分析。
B/S架构:使用者使用浏览器访问,自动化完成数据分析
覆盖平台广:支持二代和三代多个测序平台数据
可视化:分析结束后,可直接在网页上进行查看
产品名称 | 宏元™病原微生物生物溯源分析系统 |
规格 | PathTrace 1.0 |
功能模块 | 菌株中心,参考基因组,项目中心 |
样本类型 | 实验室分离培养的菌株 |
测序类型 | DNA测序 |
分析时间 | ~ 2h |
安装条件 | 内存:512GB CPU:Intel(R) Xeon(R) Gold 2.0GHz *32核 硬盘:Raid5 10TB(详见说明书) |
应用 | 单菌测序数据组装溯源 |
适配测序平台 | MGISeq200/MGISeq2000 + Pacbio, Nanopore等 |
适配测序读长 | PE150等 |